View Summary Pdf File Gene model: evm_27.model.AmTr_v1.0_scaffold00002.177
IDENTIFICATION
Species Name
Amborella trichopoda
Locus:
evm_27.model.AmTr_v1.0_scaffold00002.177
Gene Model:
evm_27.model.AmTr_v1.0_scaffold00002.177
Description:
AtrEXLB-02
Family:
Expansin Like Beta
3D Structure:
2HCZ

Genome Databases:
Tair
Kegg
External Resources
GabiPD
Gene Structure:
Domain Architecture:
Peptide Sequences
>AtrEXLB-02
MALLLALPTCSLSQDASASASASAFVCSRATFYGSPDCLGTPSGACGFGEFGRRINGGDVGGVAKLYKNGTGCGACYQVRCTQPQVCNPYGLTIVVTDYGEGDHTDFILSTSAYSKLALPNMALELMAYGVVDIEYRRVSCQYPGYNMMFKVHENSRYPDSLALVIWYQAGQYDITAVELWQEDCKEWRGMRRAYGAVWDMPNPPNAGAGLNLRFRVSGGVEGEKWVVLPNAIPTNWKAGAVYDSTIQLS*
CDS (Coding Sequence):
>AtrEXLB-02
ATGGCTCTCCTCCTTGCGTTACCTACGTGCTCTCTCTCTCAAGACGCCTCGGCCTCCGCCTCCGCCTCCGCCTTTGTGTGCTCTAGGGCCACCTTCTACGGGAGCCCAGACTGCCTTGGAACCCCAAGTGGAGCTTGTGGGTTTGGAGAATTCGGTCGAAGAATTAATGGAGGCGATGTTGGGGGGGTTGCTAAGCTCTACAAGAATGGCACTGGTTGTGGAGCTTGCTACCAGGTGAGGTGCACCCAACCCCAAGTTTGCAACCCCTATGGTTTGACAATTGTGGTGACGGACTACGGTGAGGGTGACCACACAGATTTCATCCTCAGCACAAGTGCCTACTCCAAGTTGGCACTTCCTAACATGGCCCTTGAGCTCATGGCTTATGGTGTAGTAGATATCGAATACAGGAGGGTGTCATGCCAGTACCCAGGCTACAACATGATGTTCAAGGTCCATGAGAACAGCCGATACCCGGACTCCTTGGCCCTTGTCATTTGGTACCAAGCCGGCCAATACGACATCACTGCTGTCGAATTGTGGCAGGAGGATTGCAAGGAATGGAGGGGAATGAGGAGGGCGTATGGGGCAGTGTGGGACATGCCCAACCCACCAAACGCAGGGGCTGGCCTTAACCTTCGGTTCAGAGTCTCCGGTGGCGTCGAGGGAGAGAAATGGGTCGTCCTGCCCAATGCCATTCCTACCAATTGGAAGGCAGGAGCCGTCTATGACTCCACCATACAGCTTTCTTAA
Nucleotide:
>AtrEXLB-02
ATGGCTCTCCTCCTTGCGTTACCTACGTGCTCTCTCTCTCAAGACGCCTCGGCCTCCGCCTCCGCCTCCGCCTTTGTGTGCTCTAGGGCCACCTTCTACGGGAGCCCAGACTGCCTTGGAACCCCAAGTATCTCTCTTTCTCTTCACCTACAAATCATCATCACTCTCGTTTCGAGCTTGCATGTACGATTAGACATGTAATCTCTTATTTTTTATAGAATAAGGGATTCATGATTTGTTCTCTCTCTATAGCATGTATGCATCCGTAGCCATACAAGTTATGAGTCTCTCCATAAACAATGCATGTGCAACTACATTTGCACTCTATTTTTTTTTTTGTAAAAAAGATTGTATGCTATGATACTATTTATCATTGTCACAACCAATCCTTGTCAATAGATTTCAAATTGGATGGTTTGAGATAGTCATGAAGTTCGAGATTTTTTTTTTTAAACTTTAAGTCGAGTCAATGAAACATACACACTTAAAATTAGAAGGACAAGAGTGATTGTGGCCTACTTGTACTAAAAGTGTAAGTGGCCTCTTTGTATATCTTGTCTTTTATTGTTTCCTTTAAAAATATATGCAAAGGCAAAGATTATAGTGAATTGATGAAACAGGTGGAGCTTGTGGGTTTGGAGAATTCGGTCGAAGAATTAATGGAGGCGATGTTGGGGGGGTTGCTAAGCTCTACAAGAATGGCACTGGTTGTGGAGCTTGCTACCAGGTACTAACCTCTCTATAAACACACATGCTCTTTCTCTGGACTCAAATTTATTCAAACACATACAGTTAATTTTTCTATAAAGCTTCAAAAAGGAAAAGATTTTTAGTCTTCAAAATATTACATTTTGTGATAAAATTATTTGGATAGTCCATTTTCAATATTTTTAAAGGTTTATGGTTTTTGCTCGATCTGTATCAAGTTTACGTGTTTCAATTGCTTTTAGTTAATTAAGAGTGGAACTAGATTTTGATGCCCTTTACAACATCAAATTTGTATCTTTTGAAAATGCCTTTTTATTTTAAGGGATTGTATACCATGATATCATTTACCATTGCTAGACGGAAGCACTCCTAATCATTAGATGTCAAATTGGATGTTAGGAGTCGCAACGTTTATTTATTTATTTATTTTTTTTGAAACTTTGCGTCTAGTTAATGACACGCTAACAACCACGTGATTTAAAATCTAATAGATAGGAGCAATTCAAACATCATTTTACTTGAAATAAATGGTCTCTTTGTATACTTTTCCTAATTTAATTGTTTTAAGTTGATGCCAGGTATAAATCGCACCCCTCAAGCTTCCCGCTTTGTTAATTAACATATGTTAGTGACCAAAACGATCTTGGAGTGACTCGTTAAATTAATAAAATATTTGAACTCAAGTTTTGGAGGTACAATGGTCCCAAATTCACACTAATGGAACTGTCTTGGTGTTTGAACTCTCTCTCTCTCTCACTCTCTCTCTCTCTCTTCATCCTTTTATAATTAGGAGACCTCCCTCTCTCATTTCATGTTTTAATCAGCAGACTTGAATAGCAAAACAAAAGGCAAAAAAATCGAAGTGCTACAATGCATCATCGTTTCAAACTTTTGAAATGATAGTTTAGTTAGATGTAAAGAAGGTTCGACTTAATATGTATTTATGTTACCATGTTAATATGTTACGTAGCATGGACAATTCTCTCTCTTGAATGATTGATTGGTGGGTGGAAATAGGTGAGGTGCACCCAACCCCAAGTTTGCAACCCCTATGGTTTGACAATTGTGGTGACGGACTACGGTGAGGGTGACCACACAGATTTCATCCTCAGCACAAGTGCCTACTCCAAGTTGGCACTTCCTAACATGGCCCTTGAGCTCATGGCTTATGGTGTAGTAGATATCGAATACAGGAGGTAAAAAACAGAGTCCCTCTCTCTCTCTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACAATGGATGTTGAATTTGTGGAGACAGGGTGTCATGCCAGTACCCAGGCTACAACATGATGTTCAAGGTCCATGAGAACAGCCGATACCCGGACTCCTTGGCCCTTGTCATTTGGTACCAAGCCGGCCAATACGACATCACTGCTGTCGAATTGTGGCAGGTTTGCTCTTTCCCTCTCCCTCTCATTCTCTCTCTCTCTCATATGATTTCTTGAATGCAGTTTCTTAGTAGTTTGTGAGGATTTGTTGAATTGAATGAAATGCTTGTTTGAAGGAGGATTGCAAGGAATGGAGGGGAATGAGGAGGGCGTATGGGGCAGTGTGGGACATGCCCAACCCACCAAACGCAGGGGCTGGCCTTAACCTTCGGTTCAGAGTCTCCGGTGGCGTCGAGGGAGAGAAATGGGTCGTCCTGCCCAATGCCATTCCTACCAATTGGAAGGCAGGAGCCGTCTATGACTCCACCATACAGCTTTCTTAA