View Summary Pdf File Gene model: evm_27.model.AmTr_v1.0_scaffold00001.273
IDENTIFICATION
Species Name
Amborella trichopoda
Locus:
evm_27.model.AmTr_v1.0_scaffold00001.273
Gene Model:
evm_27.model.AmTr_v1.0_scaffold00001.273
Description:
AtrEXLA-01
Family:
Expansin Like Alpha
3D Structure:
2HCZ

Genome Databases:
Tair
Kegg
External Resources
GabiPD
Gene Structure:
Domain Architecture:
Peptide Sequences
>AtrEXLA-01
MAFFIFILLLSLSSAMACDRCVHRSKVAYYSSPSAIPAGACGYGSMALAFNGGYVAATSSALYREGIGCGACFQIRCTDWTVCSKGGSQIIVTDLNYDNHTEFVLSGAAFFGMARKGMKQQLKKIGVAVVEYKRVPCDYKNKNLSVMVEESSQYPYYLAVKFVYQGGQTDIVAVDVAQVGSSNWRYMTRNHGAIWDTNRVPQGALQFRLVVTGGYDGKWIWAQSVLPADWTKGAVYDSGVQIHDIAQEGCSPCDSEDWHS*
CDS (Coding Sequence):
>AtrEXLA-01
ATGGCATTCTTCATCTTTATTCTCCTTCTTTCGCTCTCTTCTGCGATGGCCTGTGATCGATGCGTCCATCGATCAAAGGTCGCCTACTATTCCTCCCCTTCTGCAATTCCAGCTGGGGCGTGCGGTTATGGCTCCATGGCACTGGCTTTCAATGGTGGATACGTTGCTGCTACAAGCTCTGCTTTGTACCGAGAAGGAATTGGTTGTGGCGCCTGTTTTCAGATTAGGTGCACAGATTGGACTGTATGTAGCAAAGGGGGATCACAGATTATCGTCACTGACCTCAATTACGACAACCACACCGAATTTGTGCTGAGTGGTGCTGCCTTTTTCGGGATGGCTAGAAAGGGAATGAAACAACAACTAAAAAAAATTGGGGTTGCAGTTGTTGAATATAAAAGGGTACCATGTGACTATAAGAATAAGAACCTCTCTGTAATGGTGGAAGAGAGTAGCCAATATCCATACTATCTGGCCGTCAAATTCGTGTATCAAGGGGGCCAAACAGACATAGTTGCAGTCGATGTTGCTCAAGTGGGTTCTTCGAATTGGCGTTATATGACGAGGAATCATGGAGCAATTTGGGATACAAACAGAGTACCGCAAGGGGCTTTGCAATTTAGGTTAGTTGTGACAGGGGGGTACGATGGTAAATGGATATGGGCACAAAGTGTTCTTCCCGCTGATTGGACAAAAGGGGCTGTATATGATTCAGGCGTTCAGATACACGACATTGCTCAAGAAGGTTGCTCGCCCTGTGATTCAGAAGACTGGCACTCATAG
Nucleotide:
>AtrEXLA-01
ATGGCATTCTTCATCTTTATTCTCCTTCTTTCGCTCTCTTCTGCGATGGCCTGTGATCGATGCGTCCATCGATCAAAGGTCGCCTACTATTCCTCCCCTTCTGCAATTCCAGGTACCATTTCACGATTCCATTGTCTTTCTTCCTTTAATCCGTATTTTGTGTGGATTTTTTTTATGGGTTTTGCGGTTGCCTTATGTTGTTGATCGGAGATTGTGATTTTCAGCTGGGGCGTGCGGTTATGGCTCCATGGCACTGGCTTTCAATGGTGGATACGTTGCTGCTACAAGCTCTGCTTTGTACCGAGAAGGAATTGGTTGTGGCGCCTGTTTTCAGGTGCTTGCTTTACTATTTTCTCTCTCTAAAACTTCTTTCTCTTCTCTCGTTTTTCTCTCTTGATTCTTGAATTGGGTTTGGGCTTGAGCAGATTAGGTGCACAGATTGGACTGTATGTAGCAAAGGGGGATCACAGATTATCGTCACTGACCTCAATTACGACAACCACACCGAATTTGTGCTGAGTGGTGCTGCCTTTTTCGGGATGGCTAGAAAGGGAATGAAACAACAACTAAAAAAAATTGGGGTTGCAGTTGTTGAATATAAAAGGTGAAAACCCAATTCTCTCTCTCTCTACTCTTCTTCTTTTTTCTTTTTTTTTTTAATTTATTTATTTATTTTTTTAACAGTTGGGTTCTTTGTTGTAATGTATTGTTGCGTTGCAGGGTACCATGTGACTATAAGAATAAGAACCTCTCTGTAATGGTGGAAGAGAGTAGCCAATATCCATACTATCTGGCCGTCAAATTCGTGTATCAAGGGGGCCAAACAGACATAGTTGCAGTCGATGTTGCTCAAGTAAGTTGAGAAAATCTTTTTAAAACAAAAAAAGAGTGATTTACATACAGAGCCTAAACTTTCTTCTAAAATACAAAATATTTCGTTTATACCAGAAATTACAAAAAAAGATCAGCCAAGCTGCCTTTTATTTTTATTTTTTCTAAAATTACCTTTTGGTCAGATGGAATCTTCGATCTGAATTTTAATTTTTTCTTTTTAGTTTTTTCGTTAGTAGGGCAGCCCTTAGGGTAGTACGGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAGGCACGAAGATTTACCGAGATGCAATTTTGAAAAAATATATAAAAAAAAAAGATTGACGGACCTTCGTTGTAATTCTCACCTATAAATGTATTTTTGTATCTTAAGAAAAAATTTAAAGTACATACGTAAATCACACAAAAAAATAAAATAAAATCCATGCATGAATTCCTAGCCTAAGGCTTCATAGGTCATAAGAAACTATACCCATTTTTTCCCCAAAACAAGTAAAAAAAAAATAGAGATCTTTAAGGTCTTTCATGAAAAATGTGGAATTTTTTTGCAGGTGGGTTCTTCGAATTGGCGTTATATGACGAGGAATCATGGAGCAATTTGGGATACAAACAGAGTACCGCAAGGGGCTTTGCAATTTAGGTTAGTTGTGACAGGGGGGTACGATGGTAAATGGATATGGGCACAAAGTGTTCTTCCCGCTGATTGGACAAAAGGGGCTGTATATGATTCAGGCGTTCAGATACACGACATTGCTCAAGAAGGTTGCTCGCCCTGTGATTCAGAAGACTGGCACTCATAG