View Summary Pdf File Gene model: evm_27.model.AmTr_v1.0_scaffold00009.394
IDENTIFICATION
Species Name
Amborella trichopoda
Locus:
evm_27.model.AmTr_v1.0_scaffold00009.394
Gene Model:
evm_27.model.AmTr_v1.0_scaffold00009.394
Description:
AtrEXPB-01
Family:
Beta Expansin
3D Structure:
1N10

Genome Databases:
Tair
Kegg
External Resources
GabiPD
Gene Structure:
Domain Architecture:
Peptide Sequences
>AtrEXPB-01
MHLCALFCEGGACGYGTLVDVRPLKARVGAVSPVLFKAGEGCGACYKVKCLDTNMCSRRAVTIIVTDECPGGYCSGGKTHFDLSGSAFGRMAVAGNGGSLRNRGEIPVIFRRTKCKYPGKNIAFHVNEGSTEYWLSLLVEFEDGDGDVGSMQIKEAGSGTWLQMSHLWGATWCFVGGPLSGPLSVKITTLSSKRSLSARDVIPRNWSPKATYTSRLNFF*
CDS (Coding Sequence):
>AtrEXPB-01
ATGCATTTGTGTGCTTTGTTTTGTGAAGGTGGAGCTTGCGGCTATGGAACACTTGTAGATGTGAGGCCACTGAAGGCTCGAGTCGGGGCGGTGAGCCCGGTCCTCTTCAAGGCTGGCGAGGGCTGCGGCGCCTGCTACAAGGTGAAATGTCTCGACACGAACATGTGCTCGAGGCGGGCCGTCACCATTATCGTCACCGATGAGTGCCCGGGTGGATACTGCTCCGGCGGGAAGACACACTTCGATCTGAGCGGCTCCGCCTTCGGGCGCATGGCCGTCGCCGGGAATGGCGGTTCACTGAGGAACCGAGGCGAGATTCCGGTCATTTTCAGGAGAACCAAGTGCAAGTATCCAGGAAAAAACATTGCCTTTCATGTAAATGAGGGATCAACAGAGTATTGGCTCTCACTATTGGTCGAGTTTGAAGACGGGGATGGTGATGTTGGATCCATGCAGATCAAAGAGGCCGGTTCAGGGACATGGTTGCAAATGTCTCATTTGTGGGGGGCAACCTGGTGTTTCGTGGGGGGTCCACTTTCAGGTCCCTTGTCTGTGAAAATAACGACTTTATCAAGCAAAAGAAGTCTCTCTGCAAGGGACGTTATTCCCCGTAACTGGTCTCCCAAGGCCACTTACACTTCTCGCCTTAACTTTTTCTAA
Nucleotide:
>AtrEXPB-01
ATGCATTTGTGTGCTTTGTTTTGTGAAGGTGGAGCTTGCGGCTATGGAACACTTGTAGATGTGAGGCCACTGAAGGCTCGAGTCGGGGCGGTGAGCCCGGTCCTCTTCAAGGCTGGCGAGGGCTGCGGCGCCTGCTACAAGGTGAAATGTCTCGACACGAACATGTGCTCGAGGCGGGCCGTCACCATTATCGTCACCGATGAGTGCCCGGGTGGATACTGCTCCGGCGGGAAGACACACTTCGATCTGAGCGGCTCCGCCTTCGGGCGCATGGCCGTCGCCGGGAATGGCGGTTCACTGAGGAACCGAGGCGAGATTCCGGTCATTTTCAGGAGGTGATTTTTTTTCTTCTCTCTCTAGACATGGTTTTGAGGTGTTTGTTTGAAAAAGGTTGGGAGTGAGTTCTCTGTTTTTTTTGGTGGTAAATTTATTTATTTTATTTTGGTTTTCTATTTTCTTTCTTGGTTTAGTAATGTATTATGTTCCCCAAAATGGTTTTTCGTTGTCGAGTTTTCACTTAGTTTATTTGGTTTTCTTTTTACTGTTAATTTTTCCTGATTTATGTTTTTTTTATTTATTGATTTTTCCAAATTTAGCTTATTCCATTTGGTTTTATGGTTTTTTTGGGTACTAATTTTTCCAATTTTTTTTTAATTTTCCCAGTTTATTTGGATTTTTATTTATAATTTTCCCATGGTTTATTTGTGTTTCTAGTAGAAAATTTTCCTACTTTATTTGGTTTAATTTTCCTAGTTTATTTGGATTTTTATTTATAGTTTTCCCATGATTTATTTGTGTTTTTAGAAGCAAATTTTCCTACTTTATTTGATTTATAGGGTTTCTTGAGTTTTTGACCGAGAATGCTAATTTTGGTTTTCTAGGGGTAATTTTAAATTAATTATTTAGATATAAACTGTATTTGGGGCCACTTTTTAGTTAGGTTTCTTAAGATTTTTATTATATATTTTCTCATAGTAATTTTTTTTATTTAGAACTTTTTTGTTTAGGTAAATAGGAATATAGCGAATTTTCTAAAGTAAGAAGAAAAATAGCAAAGTCTCTCCTATTTGATGGCTAGATTCTTGTCATTTAAATTGGTGAACTGGTTTTGTTGTGTGTGTGTGTGTTTCTTTTTGGTTTTACAATTTTTTTGAAGGGTGCAGCTGGCATACGAATTCATCTGTAGCTGTAGAGCTAAGGTGCACATTCAAATTAAATTTTATCATGATATATAATTTTGATGTAAAATATTTTTAGGATTATCTCAAAATCTATTTTTATGTTTAATTATAAAATTTTAAATTTCAAAAATGGTTAAACTCAAGTAGATCTATAAACACATGAAAATCTTGAAAATTGATGGTGTAGATAATATGTTGTAAAATACACTATTTTTTATACTTAAAATCCTTTTATTTTTCGTGGCCATACATCTCAACATCGAGATGATCAATCAAAGGGTTTTTCAACATTAAAACTACCCTTTCCGATGGAAATTTTGAGGTGTATCCATAGTTTTACCTTATAAGGTTGCATCCTTATACAAACTTTTTCCTTTTTTTGAAACTCCATAACAAACGAAGTCAAAAGGAAATTTGTCGAAGATGAACTATTTGACATGTCACTTTTTTAATTTTATGTAAAAGAATTTCATCTCAAGACACATGAGCATGAAGACATATAATCATGTGCAATCATGAGCTAATATATAAGTTCAACCCTACGAAGTAAGTAAAGCATCACCTCATAACTTATCAATGATTACAATTCAAGTATCGGAAAGCTTTTACATCATCTCGACTCAAACATTAAAGTTATAAAAAAAAATTAGATTTCAAGCTCTAAAAATAGTGTATGTAATAACAAATTATTTAAACCATCCATTTTACCCTAGAAATAAGTGTTCACATATGAGAAAGATTTGTACCATTTTTTTAGTTTCAAAGTTTATTATTGGTGTTGAAAATTGATTTTAGAGCCAACATAGAGATTTATTTTGCCTAAAGGTTTTTTGGGGATTTGAGGTGAAGCTTTATTTTGTTTTCGTAAAATCCTAGACGGTATAGAAACCTCATCCTTTAATAAAATTTCCCTTAACTAATTATTTGTACTTGTAGGCTTATTATTATAAACTTTTCCACCATTATGGCTAGAAAGTTCTTACTCATTGTTTATGGGTGCGGTTTCAATAAGGTTACAACCTTAAACAATCCAATTAAGGCGCACTTCTAAATTTTATTATAACATGTAATTTTGGTATAAAAAGTTCGTAGGATTATCTAAAAATGGTATTTTCATATCTAATTATAAAATTTTAAACTCCAAAAATAGTTAAAATCATGTAAATCTATAAAAAATGTGAAAATCTTGAAAATGGACGGTCTAGATAATGTGTTGCAAGATGCACTATTTTTACAACTTAAAAATATATTTTTTTAACATATTCATATATCTTGATGTCAAGATGATCAATTAGAGGGTCTTTCAACATTAGAATAACCTTTTTCCAATGGATTTTTGTGGTGCATATGTATTTCTACATTTTAAAGTTGCAACCGTATATAAACTTTTCCTTTTATTTATTTATACAATATGACTATTTGATTTTTAAGTCATCATCACCGTTGCCTTTGAATGTGAAATTGTGCGGTTAAACTTGAAGTCTTAACTTAAAATTATAACTTGAATTCCGTGACACATTTTAAGGTGTAAAATTTCACATCTAACAATTATGGTAATTACAACTTTATTGTACCAAAAGTAGATGGTCGCAAAGAGTATAATATTTCTATTTATTTATTTTATTCAACAGAACCAAGTGCAAGTATCCAGGAAAAAACATTGCCTTTCATGTAAATGAGGGATCAACAGAGTATTGGCTCTCACTATTGGTCGAGTTTGAAGACGGGGATGGTGATGTTGGATCCATGCAGATCAAAGAGGTATGTTCACTTCGTTGTTATTGGAAAAAGGAAAGCATTTCTATTTTCCTCCACACATAATTTTACATATATTTTATGTGCTTAGAGACCCACATATGTCTAAACAGTTGTAGTTGAAGGTGAGTCGAAAACAATGATACATAACTATGCTACTCAACCATAACTAATATGTAAAATTATTATCAATTTACTCTTAGATTTTTTTATTAAATATATCCCCAAACATATATAAATTTAGAGTATAAGTGTGTGGAGTCTCATGAAAAATCTACCAAAAATTTCCTTTACTTTGTTTCAGTATTTCAAAATCTTGGTAAATGTGGTAGATCCTTCACCCCACAAATAATATAAAGTCGTAACTAATCTTTCTAATCAAGCAATCGTTTTTTTTACTAAATGAGTAAGCAATTATCATCATCGTTTATTTGATCCTTATCACAATTATTTGAGCTTGATTACACGAATCTTAATTTTAACATTTATGAAACAAATGTGGCTAAAATTTTAAGGGGCATGGAACCTAACACAACCATTTTTTTTTTTTGTTTTTTGTGCAGGCCGGTTCAGGGACATGGTTGCAAATGTCTCATTTGTGGGGGGCAACCTGGTGTTTCGTGGGGGGTCCACTTTCAGGTCCCTTGTCTGTGAAAATAACGACTTTATCAAGCAAAAGAAGTCTCTCTGCAAGGGACGTTATTCCCCGTAACTGGTCTCCCAAGGCCACTTACACTTCTCGCCTTAACTTTTTCTAA