View Summary Pdf File Gene model: Lsat_1_v5_gn_4_11020.1
IDENTIFICATION
Species Name
Lactuca sativa
Locus:
Lsat_1_v5_gn_4_11020.1
Gene Model:
Lsat_1_v5_gn_4_11020.1
Description:
LsEXPA-12
Family:
Alpha Expansin
3D Structure:
2HCZ

Genome Databases:
Tair
Kegg
External Resources
GabiPD
Gene Structure:
Domain Architecture:
Peptide Sequences
>LsEXPA-12
MAILGFLVVGFLSIASSVNGDGGWVNAHATFYGGGDASGTMGGACGYGNLYSQGYGTNTAALSTALFNNGLSCGSCFEIKCVNDHQWCLPGSIKVTATNFCPPNSDGGWCNPPNQHFDLSQPIFQHIAQYKAGIVPVAYRRIPCVRRGGIRFQINGHSYFNLVLITNVGGAGDVHSVAIKGSKTGWQQMSRNWGQNWQSNNYLNGQSLSFKVTTSDGKTVVSNNVVPAGWSFGQTFAGAQFR*
 
CDS (Coding Sequence):
>LsEXPA-12
ATGGCTATTTTGGGTTTTTTAGTTGTGGGTTTTCTCTCAATTGCGTCCTCCGTCAATGGCGACGGTGGTTGGGTCAATGCACATGCCACCTTCTACGGCGGTGGTGATGCCTCCGGCACAATGGGTGGTGCTTGTGGGTATGGGAATCTGTATAGTCAAGGGTATGGTACAAACACAGCAGCGTTAAGTACTGCTTTGTTCAACAATGGTTTGAGCTGTGGCTCGTGCTTTGAAATCAAGTGCGTGAATGACCATCAATGGTGTTTGCCGGGGTCTATTAAGGTCACCGCCACCAACTTCTGCCCACCGAACTCCGACGGTGGGTGGTGCAACCCTCCTAACCAACACTTCGATCTCTCTCAGCCTATCTTCCAACATATTGCTCAATACAAAGCCGGAATCGTCCCTGTTGCTTACAGAAGGATACCATGCGTTAGAAGGGGTGGGATTAGGTTCCAAATCAATGGACATTCGTATTTCAATTTGGTGTTGATTACAAATGTGGGTGGCGCCGGTGATGTTCATTCGGTGGCAATTAAAGGGTCAAAGACTGGGTGGCAACAAATGTCAAGAAACTGGGGGCAAAATTGGCAATCCAACAATTATCTCAACGGGCAGAGTCTGTCTTTTAAGGTCACCACAAGTGATGGTAAAACCGTGGTGTCTAACAATGTTGTTCCTGCTGGCTGGTCTTTCGGGCAGACCTTCGCTGGTGCCCAATTCAGATGA
Nucleotide:
>LsEXPA-12
ATGGCTATTTTGGGTTTTTTAGTTGTGGGTTTTCTCTCAATTGCGTCCTCCGTCAATGGCGACGGTGGTTGGGTCAATGCACATGCCACCTTCTACGGCGGTGGTGATGCCTCCGGCACAATGGGTATGTAATATGTTTTTCTTCATCTTCTAATCTTCAAATCTTTACTCTCCTTATCTCTATCTCTCTATTTCTTCGATTAATTGACTGAGATTTGGTGTTATTTTGATAGGTGGTGCTTGTGGGTATGGGAATCTGTATAGTCAAGGGTATGGTACAAACACAGCAGCGTTAAGTACTGCTTTGTTCAACAATGGTTTGAGCTGTGGCTCGTGCTTTGAAATCAAGTGCGTGAATGACCATCAATGGTGTTTGCCGGGGTCTATTAAGGTCACCGCCACCAACTTCTGCCCACCGAACTCCGACGGTGGGTGGTGCAACCCTCCTAACCAACACTTCGATCTCTCTCAGCCTATCTTCCAACATATTGCTCAATACAAAGCCGGAATCGTCCCTGTTGCTTACAGAAGGTGAGAAATTACGAAAACACCCTCACACCCAACTCACAAGGGTATTATGGTAACTTCACTTAACGTATTTTTCTTTGTTTTTGTAGGATACCATGCGTTAGAAGGGGTGGGATTAGGTTCCAAATCAATGGACATTCGTATTTCAATTTGGTGTTGATTACAAATGTGGGTGGCGCCGGTGATGTTCATTCGGTGGCAATTAAAGGGTCAAAGACTGGGTGGCAACAAATGTCAAGAAACTGGGGGCAAAATTGGCAATCCAACAATTATCTCAACGGGCAGAGTCTGTCTTTTAAGGTCACCACAAGTGATGGTAAAACCGTGGTGTCTAACAATGTTGTTCCTGCTGGCTGGTCTTTCGGGCAGACCTTCGCTGGTGCCCAATTCAGATGAAAAGACGTTTTCACCCTTGTTTGGGAAATTGGTTTTAGTGGTCACCTTGGTGTTACTATTGTATCTTTTAGCAACTACAATAGCTACTACTACACTACTGCTATAATGACTAAGGGCTTATTTTGATAGGGTCATTTTAGTCATTTTGTTTTTTTAGGGTGCCCATCTAGTTTTTAGTTTAGGGTGCCCTAGGGTTTGTTTTGGGTTTGGGGTTGGTTTTCTTTCTTTTTTGTGTTTTAGGGCAGTGGTGGACTATTACCACCCGCCATAGTCGTAATTGACGTTTTTGCCCTTGGTATTGGGCCATTAGAAATCTTTTTTATTTTTGCATTGTATTGGGTTTTGTGAGGTGTTAAGTTGTAAATTTACGTTTTTTTATTAGTAATGAAAGGTGACTACTCTACTTACTACTGCATT